CEJA fue creado en 1999, por resolución de la Asamblea General de la OEA. Los Cancilleres de los Estados Miembros dieron cumplimiento de ese modo al Plan de Acción de la Segunda Cumbre de las Américas (1998), y a las recomendaciones de las Reuniones de Ministros de Justicia y Procuradores Generales de las Américas (REMJA).

CEJA se rige por su estatuto y su reglamento, debiendo sus actividades desarrollarse de acuerdo con las directrices contenidas en las conclusiones y recomendaciones de las REMJA.

Su Consejo Directivo está integrado por siete miembros elegidos a título personal por la Asamblea General de la OEA.

El Consejo Directivo nombra al Director Ejecutivo, con acuerdo de la REMJA, quien tiene a su cargo la operación del Centro.

Mandato de la Segunda Cumbre
Santiago, Chile, 1998
Los Gobiernos… Impulsarán el establecimiento de un centro de estudios de justicia de las Américas, tendiente a facilitar el perfeccionamiento de los recursos humanos, el intercambio de información y otras formas de cooperación técnica en el Hemisferio, de conformidad con los requerimientos específicos de cada país. Solicitarán a los Ministros de Justicia o a otras autoridades competentes que analicen y definan las medidas más convenientes para la organización e instalación del mencionado centro.

Mandato de la Tercera Cumbre
Québec, Canadá, 2001
Desarrollarán un plan de financiamiento para CEJA que tome en cuenta los intereses y recursos tanto de Gobiernos como de otros posibles donantes, y que permita al Centro contribuir no sólo a la modernización y formulación de las políticas públicas en este ámbito, sino también al desarrollo institucional de los sistemas judiciales de la región.

Mandato de la Cuarta Cumbre
Mar del Plata, Argentina, 2005
A propósito del “Fortalecimiento a la Gobernabilidad Democrática”, se instó a: “Consolidar la Red Hemisférica de Intercambio de Información para la Asistencia Judicial Mutua en Materia Penal y Extradición, apoyar las acciones para la implementación de un plan estratégico para el Centro de Estudios de Justicia de las Américas (CEJA) y fortalecer el desarrollo institucional de la Secretaria General de la OEA en estos temas, de conformidad con el marco de las Reuniones de Ministros de Justicia o de Ministros o Procuradores Generales de las Américas (REMJA”).